由2002年开始，渠务署相继推出了多个管理系统，例如：ISO9001品质管理系统、ISO14001环境管理系统和OHSAS18001职业健康及安全管理系统等，从而不断改善服务质量、工作环境及职安健的管理。

为赞扬和嘉许本署多年来于多方面的努力及有效的管治，香港品质保证局向多间机构包括本署颁发「多元体系管理机构」(Outstanding Organization with Comprehensive Management Systems)的奖项。颁奖典礼于2014年11月28日举办的香港品质保证局25周年庆祝酒会内进行。