污水被輸送到昂船洲後，會經由兩座分別抽送第一期和第二期污757水的主泵房從深層隧道抽往地面。兩座主泵房將由隧道接通，以便有需要時把污水分流，從而提高泵房運作的可靠性。
兩座主泵房的內部直徑均超過55米，並深達40米。建造主泵房時需要在隔膜牆內進行深層的挖掘工程。巨型抽水泵位於泵房的底層，由變速摩打驅動，把隧道內的污水抽往沉澱池。
主泵房外觀
