经昂船洲污水处理厂处理后的污水会由一条直径5米、长1.7公里、途经北航道下100米深地底的隧道，排放至昂船洲西南面对开的水域。它经两条直径3.25米的垂直管道，连接至一条长1.2公里横放于海床的扩散器管道。经处理后的污水会利用扩散器管道上的24个扩散器排入海水稀释。
