本署所采纳的生态和景观改善措施通常来自新工程项目的环境影响评估。我们亦藉传阅内部指引，令工程师对保护生态方法，更俱理解及用之有法。 本署在改善生态方面的工作包括：
我们亦会在湿地建造两个蝙蝠的栖所，使更多这类哺乳类飞禽可在湿地栖息。
俱生态价值而又会被吸引至元朗排水绕道湿地的动物，会包括灯心蜻蛉、条纹狭口蛙、蝙蝠例如东亚家蝠，又会有本土雀鸟和侯鸟，例如白鹭、池鹭、滨鹬和濒危的黑脸琵鹭等。
我们特此已成功在该湿地中央及近岸地方裁种湿地植物，例如莲花、十字苔和丁香蓼。现在池水和水域边缘已有多种植物、淡水鱼类、两栖动物和蜻蜓等生长。
自从辟设人工湿地后，已录得有44种鸟类前来觅食，包括苍鹭、钓鱼郎、鹬、董鸡和东方大苇莺这些本地品种、越冬候鸟和候鸟等。
昂坪污水处理厂的主要服务范围，包括宝莲寺、昂坪村及日后与东涌吊车站相关的主题村落。污水处理厂大部分的主要建筑物会建于地底或会覆盖起来。我们亦已在景观图注明，须种植大量本地乔木和灌木，以填补受影响的植物、遮蔽敏感的景观，并为当地居民、工作人员和游人带来环保效益。
此外，上层建筑物的设计和外观会采用传统中国元素和颜色，并以现代方式演译，使该污水处理厂毫不碍眼，而与四周环境和谐协调。
究过当区的地形和社区背景，从而构思了可融入周边环境，又一丝不苟的建筑设计。
